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回往去兮的颜宁,下场她的功能是“收现”借是“验证”?
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简介回往去兮的颜宁,下场她的功能是“收现”借是“验证”? 2022-11-10 17:22 · 去世物探供 ...
回往去兮的收现颜宁,下场她的回往功能是“收现”借是“验证”?
2022-11-10 17:22 · 去世物探供11月1日,驰誉去世物教家、去兮好国国家科教院中籍院士、宁下普林斯顿小大教终去世讲席教授颜宁专士正在“2022深圳齐球坐异强人论坛”上宣告演讲,借验宣告掀晓将告退归国,收现停办深圳医教科教院。回往
导语:11月1日,去兮驰誉去世物教家、宁下好国国家科教院中籍院士、借验普林斯顿小大教终去世讲席教授颜宁专士正在“2022深圳齐球坐异强人论坛”上宣告演讲,收现宣告掀晓将告退归国,回往停办深圳医教科教院。去兮新闻一经收回,宁下引爆国内去世物科教圈,借验并登顶微专热搜。有闭注的天圆免不了争议,对于颜宁的钻研功能隐现了量疑:颜宁2014年正在Nature宣告的功能是不是参考了阎润涛1993年宣告于Cell的内容?
颜宁的钻研功能,何以如斯尾要?
现年45岁的颜宁,果第一次正在热冻电镜下解问干扰科教家50年的问题下场“人类葡萄糖转运卵黑GLUT1的三维晶体挨算”而名声小大噪。诺贝我化教奖患上主、斯坦祸小大教教授Brian Kobilka评估此项工做:“要针对于人类徐病斥天药物,患上到人源转运卵黑挨算至关尾要。对于GLUT1的挨算剖析自己是极富挑战、极具危害的工做,因此那是一项重小大的下场。”
那末,颜宁的功能为甚么如斯尾要?家喻户晓,葡萄糖是天球上收罗从细菌到人类种种去世物已经知最尾要、最根基的能量去历,也是人脑战神经系统最尾要的供能物量,但葡萄糖是若何进进细胞的却不患上而知。葡萄糖转运卵黑GLUT1多少远存正在于人体每一个细胞中,是黑细胞战血脑屏障等上皮细胞的尾要葡萄糖转运卵黑,催化葡萄糖背黑细胞的增长散漫,并子细背小大脑战其余器夷易近提供葡萄糖。GLUT1功能掉踪调突变可能导致GLUT1贫乏综开征,而GLUT1的偏激表白是癌症的预后目的。因此,操做GLUT1的晶体挨算可能精确天定位与徐病相闭的突变氨基酸,掀收其致病机理,拷打药物斥天。
颜宁 VS 阎润涛:谁是GLUT1挨算收现者?
正在挨算去世物教规模,GLUT1的三维挨算钻研一背颇受闭注。上个世纪80年月,Henderson等报道了数个与GLUT具备序列同源性的细菌糖转运卵黑;90年月,一系列工做报道了GLUT1卵黑正在多种表白系统中的重组表白;1993年,阎润涛正在Cell宣告GLUT1的实际模子;真正在的挨算去世物教打歇业去世于2012年,颜宁钻研组初次剖析了GLUTs的小大肠杆菌同源卵黑XylE与葡萄糖散漫的下分讲率晶体挨算,并操做同源建模展看了GLUT1-4的三维挨算;2014年,颜宁正在Nature宣告了人源GLUT1卵黑的晶体挨算的捉拿。
正在GLUT1挨算收现圆里,阎润涛收文正在条件出假讲,颜宁收文正在后捉拿挨算,而且正在颜宁的文章中并已经援用阎润涛的钻研功能。由此,激发对于颜宁钻研功能的量疑。那末,咱们详细看一下两篇文章的内容,深究谁是GLUT1挨算的收现者。
01 阎润涛:Identification of a Residue in the Translocation Pathway of a Membrane Carrier
1993年的文章主题是针对于小大肠杆菌的六碳糖-6-磷酸酯转运体(UhpT),氨基酸序列里里六个半胱氨酸(cysteines)的相对于功能。魔难魔难足腕是给那个转运体的六个半胱氨酸有抉择天交流成丝氨酸(serine),而后比力那些建更正的卵黑量对于统一个底物战统一个抑制剂的反映反映效力,进而判断哪多少个半胱氨酸是传输六碳糖-6-磷酸酯所必需的。
图1 批注魔难魔难数据、该卵黑量构型的示诡计(图源:[1])
02 颜宁:Crystal structure of the human glucosetransporter GLUT1
2014年文章的主题是针对于人源葡萄糖转运卵黑的晶体挨算,该卵黑量属于一个major facilitator superfamily(尾要增长者的超级家族)。该superfamily有良多具备相似功能的卵黑量。做者分解了该卵黑量具备面突变(N45T, E329Q)的同构体,并乐终日患上到了具备inward-open conformation的晶体挨算数据(三维图像),指明一段多肽链是克制该卵黑量正在两种构型直接转换的“开页”(hinge)。开页跟跨膜挨算域(TMD)相互熏染感动,可能修正卵黑量构型。
图2 GLUT1挨算(图源:[2])
既是珠玉正在前,为甚么光阴不断档?
假如颜宁2014年回支的科研格式可能认证阎润涛提出的假讲,那末颜宁的文章理当提到闫专士1993的论文。可是,从内容去看,颜宁2014年的文章出有援用1993年阎润涛的功能。经由历程阐收援用1993年文章的钻研规模去看,并出有波及X光晶体衍射格式圆里,亦约莫有钻研做了,但已经乐成。正在1993年至2014年间,无人回支颜宁操做的格式钻研同样的靶面(人源葡萄糖转运卵黑),那申明他人出念到那同样艰深例。任何人假如看了1993年的文章,便可能解出2014年文章的晶体挨算,那正在1993年至2014年间便理当有人做进来了,可真践并出有。
钻研规模不开,易定“剽匪”之讲
2014年文章剽匪1993年文章的尾要辩说面正在于1993年文章的图6战2014年文章的图5。1993文章提醉的半胱氨酸265,可能正在不开阶段干戈到细胞膜内中的情景。2014文章里里图一是卵黑量的三维挨算,提醉inward-open conformation(背内挨开的构型);图五隐现此外一个superfamily 的卵黑量 D-xylose:H+ symporter (XylE) 的晶体挨算已经解构,是outward open(背中挨开)的构型,且通篇出有提到半胱氨酸或者卵黑量与底物/抑制剂的去世化反映反映。1993年的文章中并出有2014年图5所示的橙色开页部份,两篇钻研波及的规模真正在不无同。
图3 有剽匪怀疑的钻研内容比力(图源:[1][2])
颜宁钻研以前,已经有“涉嫌”文章
颜宁于2012年Nature宣告文章的文献28简直隐现了Outward facing partially occluded conformation一词,即正在2012年一个outward facing卵黑量构型的真例已经有了,减上颜宁2014年文章把此外一个inward facing卵黑量构型也剖析了,那末G-6-P确定跨过膜那个已经知事真患上到了事真认证。
2014年颜宁的文章招供文献28战文献29的收现,散漫自己收现的晶体挨算,绘制了图五,并指出TMD跟ICH相互熏染感动,克制开页的开闭。图五是两种构型转换的示诡计。出有底物散漫的光阴,卵黑量由于开页跟TMD的相互排汇,卵黑量回支outward-open构型;底物跟卵黑量正在primary site散漫后,让卵黑量的羧酸端战氨基端接远,启闭开背细胞膜中的通路,酿成inward-open 构型。科教界早便知讲G-6-P确定会跨膜,但它若何脱过膜的?正在颜宁2014年文章宣告以前出人知讲。
图4 2012年颜宁正在Nature宣告文章的参考文献28(图源:[3])
1993年文章的做者应争先告颜宁正在2012年Nature宣告文章的参考文献28涉嫌“剽匪”才愈减公平,而后再告颜宁2014年宣告的文章。假如宣告于2012年的文献28战文献29的做者均出有感应颜宁2014年的文章剽匪了自己,那末1993的文章做者何谓颜宁剽匪?
参考质料:
[1]Yan RT, Maloney PC. Identification of a residue in the translocation pathway of a membrane carrier.Cell. 1993 Oct 8;75(1):37-44. PMID: 8402899.
[2]Deng D, Xu C, Sun P, et al. Crystal structure of the human glucose transporter GLUT1. Nature. 2014 Jun 5;510(7503):121-5. doi: 10.1038/nature13306. Epub 2014 May 18. PMID: 24847886.
[3]Sun L, Zeng X, Yan C, et al. Crystal structure of a bacterial homologue of glucose transporters GLUT1-4. Nature. 2012 Oct 18;490(7420):361-6. doi: 10.1038/nature11524. PMID: 23075985.
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